Em 93% das endometrioses que acometem o ovário, o cisto é formado pelo acúmulo de debris menstruais nos cistos de inclusão ovarianos, resultando em progressiva invaginação do córtex ovariano (Brosens et al., 1994). Em 1996, Donnez et al. relataram que doença ovariana ocorreria devido à metaplasia celômica nos cistos de inclusão ovariano, baseado no potencial metaplásico do epitélio celômico pélvico demonstrado nas teorias etiopatogênicas dos tumores epiteliais de ovário. Adicionalmente, o comportamento da doença que se desenvolve exclusivamente nesse local tem características sabidamente distintas da peritoneal ou de septo reto-vaginal.
